- 1222 wurde das Dorf Meinbrexen unter dem Namen "Haus des Meinbrecht" das erste Mal erwähnt.
- 1231 ist Meinbrexen als Pfarrdorf im Archivdiakonat im Bistum Paderborn zu finden. Die Kirche wurde Johannes dem Täufer geweiht. In vorreformatorischer Zeit galt sie als Reliquien- und somit als Wallfahrtsstätte.
- 1583 geht das Rittergut Meinbrexen als Cahlenberger Lehen an die Familie von Münchhausen. Sie übten das Patronat für die Kirche aus.
- 1585-1589 wurde die veraltete Kirche völlig neu errichtet. Dies veranlasste Statius von Münchhausen. Aus dieser Zeit, der Spätrenaissance, stammen der Altar, die Kanzel und die Wandfresken.
- 1695 ging das Patronatsrecht an die Familie von Mansberg, die es auch heute noch ausübt.
- 1736 wurde der Dachstuhl der Kirche durch einen Blitzschlag in Brand versetzt und beschädigt.
- 1738 wurde der Dachstuhl repariert. Anton Adam von Mansberg betreute die Arbeiten. Die Kirche erhielt während der Arbeiten auch den Turm.
- 1957-1958 fanden umfangreiche Renovierungsarbeiten statt. Die Kanzel und der Altar wurden restauriert. Das Fenster an der Ostwand wurde zugemauert und der Altar rückte in die Mitte.
- 1981 und 1987 wurden der Kirchturm mit Schiefer und das Kirchenschiff mit Sandsteinplatten gedeckt. Dies waren Vorschriften der Denkmalpflege.
- 1990 wurden umfangreiche Innenrenovierungen vorgenommen, wobei die wertvollen Wandfresken gefunden und komplett freigelegt wurden.
- 1995 wurden die Arbeiten abgeschlossen.